渔业是大农业中最早进入市场经济的行业，十四届四中全会进一步确定走社会主义市场经济道路后，我区水产养殖业走上了健康快速发展的轨道。目前，我区开发淡水养殖的品种达75个，海水养殖的品种达36个。2004年，全区水产养殖总面积25.98万公顷，水产养殖总产量177.94万吨，养殖水产品占水产品总量的64.42%，渔业在大农业中的比重为11.36%。
根据国内、国际两个市场的比较优势，2002年，农业部把我区确定为罗非鱼、对虾优势产区。2003年，自治区人民政府出台了《关于进一步加快罗非鱼产业化发展的意见》（桂政发[2004]28号），提出：从2004年—2006年连续三年，自治区财政每年安排600万元专项资金用于扶持罗非鱼（包括斑点叉尾鮰等）优势品种的产业化开发，并实行优惠电价、优惠税收的政策。自治区水产畜牧局也在每年的行业财政资金中重点安排优势品种产业化开发的扶持资金，用于加强基础设施建设和招商引资。
在市场的引导、政府的宏观调控作用下，我区优势水产品产业化发展格局已经形成：种苗生产基本自给；养殖生产开始朝规模化、标准化、组织化方向发展；加工出口能力大大提高。获得欧盟或美国出口许可的罗非鱼对虾加工厂七家，在建两家，罗非鱼对虾加工能力在15万吨以上。
随着中越北部湾渔业合作协议的生效，我区传统渔场减少。加上国家严格执行基本农田保护政策，渔业的发展空间受到明显约束。为了保持渔业的可持续发展，我区着力科学规划和开发大水面水产养殖资源。
我区内陆地区西江上游各支流，如红水河、桂奖、柳江、驼娘江、贺江等建设了大量的梯级电站，西江干流建设了长洲、桂平等综合水利枢纽，新增加了超过200万亩的水库大水面。特别是梧州、柳州、昭平、平乐、上林等地利用旧船体或专门建造船式网箱在江河流水中进行水产养殖开发取得了良好的经济效益和社会效益，这意味着境内约1000万亩的江河水域都可以开发养殖，使大水面养殖具备了广阔的开发空间。从2003年开始，我区确立了“科学规划，加快大水面开发”的工作思路。自治区水产畜牧局在梧州市和百色市隆林县召开了大水面开发现场会，并在2004年度的财政专项经费中安排了示范推广经费。全区各市县也纷纷出台扶持政策，大水面开发在全区全面展开。
今年上半年，全区网箱养殖面积141.6万平方米，产量2.11万吨，分别比去年同期增长30.1%和23.9%；围栏养殖1.3万公顷，产量1万吨，分别比去年同期增长9.4%和7.5%。现在，大水面开发除了一般群众参与外，众多的水产品加工龙头企业、水产饲料供应商、各行各业游资老板都开始涉足大水面养殖开发。其中，台资北联公司在北海合浦、钦州浦北计划投资5000万元，建设6000个网箱养殖基地的工程项目，已经完成2000多个箱的建造和放养工作；台资泉兴公司在梧州西江计划投资1亿元，建设1000个船式网箱，养殖生产力达1万吨以上的养殖项目。一期工程计划已开始实施，计划中的养殖设备制造厂正在一边筹建，一边制造，30个流水养殖设备（船式网箱）已经下水养殖，配套的种苗场已经准备了300多万尾斑点叉尾鮰鱼种。
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